Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG1Q06432 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNG1Q06432 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms