Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms