Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms