Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2C1P98194 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms