Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMF1P82094 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms