Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX3P78415 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX3P78415 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRX3P78415 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRX3P78415 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRX3P78415 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRX3P78415 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRX3P78415 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRX3P78415 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms