Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms