Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00313P59037 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms