Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms