Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RECQLP46063 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RECQLP46063 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms