Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms