Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms