Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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