Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms