Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TSPAN8P19075 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TSPAN8P19075 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TSPAN8P19075 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TSPAN8P19075 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TSPAN8P19075 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSPAN8P19075 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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