Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms