Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms