Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms