Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms