Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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