Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms