Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms