Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSF2P04141 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms