Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms