Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN5O00501 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms