Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms