Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms