Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC01387J3KSC0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC01387J3KSC0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC01387J3KSC0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC01387J3KSC0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC01387J3KSC0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms