Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms