Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms