Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K4Q9Y6R4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms