Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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