Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRPF3Q9ULD4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms