Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms