Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms