Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00474Q9P2X8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms