Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms