Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CALCOCO1Q9P1Z2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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