Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms