Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms