Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms