Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms