Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms