Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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