Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C11orf49Q9H6J7 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms