Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms