Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms