Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms