Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLF1Q9BQI6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms