Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms